Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HES3Q5TGS1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HES3Q5TGS1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HES3Q5TGS1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HES3Q5TGS1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HES3Q5TGS1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HES3Q5TGS1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HES3Q5TGS1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HES3Q5TGS1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HES3Q5TGS1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HES3Q5TGS1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HES3Q5TGS1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HES3Q5TGS1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HES3Q5TGS1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HES3Q5TGS1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HES3Q5TGS1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HES3Q5TGS1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HES3Q5TGS1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HES3Q5TGS1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HES3Q5TGS1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HES3Q5TGS1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HES3Q5TGS1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HES3Q5TGS1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HES3Q5TGS1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HES3Q5TGS1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HES3Q5TGS1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HES3Q5TGS1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HES3Q5TGS1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HES3Q5TGS1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HES3Q5TGS1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HES3Q5TGS1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HES3Q5TGS1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HES3Q5TGS1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HES3Q5TGS1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HES3Q5TGS1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HES3Q5TGS1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HES3Q5TGS1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HES3Q5TGS1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HES3Q5TGS1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HES3Q5TGS1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HES3Q5TGS1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HES3Q5TGS1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HES3Q5TGS1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HES3Q5TGS1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HES3Q5TGS1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms