Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HDGFL1Q5TGJ6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HDGFL1Q5TGJ6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HDGFL1Q5TGJ6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HDGFL1Q5TGJ6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HDGFL1Q5TGJ6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HDGFL1Q5TGJ6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HDGFL1Q5TGJ6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HDGFL1Q5TGJ6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HDGFL1Q5TGJ6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HDGFL1Q5TGJ6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
HDGFL1Q5TGJ6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HDGFL1Q5TGJ6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
HDGFL1Q5TGJ6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HDGFL1Q5TGJ6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HDGFL1Q5TGJ6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HDGFL1Q5TGJ6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HDGFL1Q5TGJ6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HDGFL1Q5TGJ6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HDGFL1Q5TGJ6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HDGFL1Q5TGJ6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HDGFL1Q5TGJ6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HDGFL1Q5TGJ6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HDGFL1Q5TGJ6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HDGFL1Q5TGJ6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HDGFL1Q5TGJ6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HDGFL1Q5TGJ6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HDGFL1Q5TGJ6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HDGFL1Q5TGJ6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HDGFL1Q5TGJ6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HDGFL1Q5TGJ6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HDGFL1Q5TGJ6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HDGFL1Q5TGJ6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HDGFL1Q5TGJ6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HDGFL1Q5TGJ6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HDGFL1Q5TGJ6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HDGFL1Q5TGJ6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HDGFL1Q5TGJ6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HDGFL1Q5TGJ6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HDGFL1Q5TGJ6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HDGFL1Q5TGJ6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HDGFL1Q5TGJ6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HDGFL1Q5TGJ6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HDGFL1Q5TGJ6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HDGFL1Q5TGJ6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HDGFL1Q5TGJ6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HDGFL1Q5TGJ6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HDGFL1Q5TGJ6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HDGFL1Q5TGJ6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HDGFL1Q5TGJ6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HDGFL1Q5TGJ6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
HDGFL1Q5TGJ6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HDGFL1Q5TGJ6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HDGFL1Q5TGJ6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HDGFL1Q5TGJ6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HDGFL1Q5TGJ6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HDGFL1Q5TGJ6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HDGFL1Q5TGJ6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HDGFL1Q5TGJ6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HDGFL1Q5TGJ6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HDGFL1Q5TGJ6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HDGFL1Q5TGJ6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HDGFL1Q5TGJ6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HDGFL1Q5TGJ6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HDGFL1Q5TGJ6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HDGFL1Q5TGJ6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
HDGFL1Q5TGJ6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
HDGFL1Q5TGJ6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HDGFL1Q5TGJ6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HDGFL1Q5TGJ6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HDGFL1Q5TGJ6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HDGFL1Q5TGJ6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HDGFL1Q5TGJ6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
HDGFL1Q5TGJ6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HDGFL1Q5TGJ6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HDGFL1Q5TGJ6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HDGFL1Q5TGJ6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HDGFL1Q5TGJ6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
HDGFL1Q5TGJ6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HDGFL1Q5TGJ6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HDGFL1Q5TGJ6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HDGFL1Q5TGJ6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HDGFL1Q5TGJ6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HDGFL1Q5TGJ6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HDGFL1Q5TGJ6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HDGFL1Q5TGJ6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HDGFL1Q5TGJ6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HDGFL1Q5TGJ6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HDGFL1Q5TGJ6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HDGFL1Q5TGJ6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HDGFL1Q5TGJ6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HDGFL1Q5TGJ6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HDGFL1Q5TGJ6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HDGFL1Q5TGJ6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HDGFL1Q5TGJ6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
HDGFL1Q5TGJ6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HDGFL1Q5TGJ6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HDGFL1Q5TGJ6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HDGFL1Q5TGJ6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms