Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SOGA3Q5TF21 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SOGA3Q5TF21 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SOGA3Q5TF21 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SOGA3Q5TF21 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SOGA3Q5TF21 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SOGA3Q5TF21 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SOGA3Q5TF21 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SOGA3Q5TF21 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SOGA3Q5TF21 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SOGA3Q5TF21 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SOGA3Q5TF21 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SOGA3Q5TF21 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SOGA3Q5TF21 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SOGA3Q5TF21 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SOGA3Q5TF21 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SOGA3Q5TF21 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SOGA3Q5TF21 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SOGA3Q5TF21 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SOGA3Q5TF21 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SOGA3Q5TF21 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SOGA3Q5TF21 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SOGA3Q5TF21 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SOGA3Q5TF21 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SOGA3Q5TF21 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SOGA3Q5TF21 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SOGA3Q5TF21 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SOGA3Q5TF21 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SOGA3Q5TF21 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SOGA3Q5TF21 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SOGA3Q5TF21 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SOGA3Q5TF21 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SOGA3Q5TF21 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SOGA3Q5TF21 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SOGA3Q5TF21 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SOGA3Q5TF21 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SOGA3Q5TF21 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SOGA3Q5TF21 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SOGA3Q5TF21 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SOGA3Q5TF21 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SOGA3Q5TF21 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SOGA3Q5TF21 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SOGA3Q5TF21 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SOGA3Q5TF21 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SOGA3Q5TF21 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SOGA3Q5TF21 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SOGA3Q5TF21 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SOGA3Q5TF21 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SOGA3Q5TF21 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SOGA3Q5TF21 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SOGA3Q5TF21 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SOGA3Q5TF21 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SOGA3Q5TF21 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SOGA3Q5TF21 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SOGA3Q5TF21 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SOGA3Q5TF21 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SOGA3Q5TF21 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SOGA3Q5TF21 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SOGA3Q5TF21 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SOGA3Q5TF21 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SOGA3Q5TF21 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SOGA3Q5TF21 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SOGA3Q5TF21 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SOGA3Q5TF21 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SOGA3Q5TF21 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SOGA3Q5TF21 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SOGA3Q5TF21 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SOGA3Q5TF21 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SOGA3Q5TF21 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SOGA3Q5TF21 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SOGA3Q5TF21 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SOGA3Q5TF21 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SOGA3Q5TF21 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SOGA3Q5TF21 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SOGA3Q5TF21 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SOGA3Q5TF21 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SOGA3Q5TF21 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SOGA3Q5TF21 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SOGA3Q5TF21 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SOGA3Q5TF21 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SOGA3Q5TF21 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SOGA3Q5TF21 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SOGA3Q5TF21 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SOGA3Q5TF21 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SOGA3Q5TF21 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SOGA3Q5TF21 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SOGA3Q5TF21 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SOGA3Q5TF21 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SOGA3Q5TF21 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SOGA3Q5TF21 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SOGA3Q5TF21 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SOGA3Q5TF21 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SOGA3Q5TF21 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SOGA3Q5TF21 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SOGA3Q5TF21 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SOGA3Q5TF21 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SOGA3Q5TF21 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SOGA3Q5TF21 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SOGA3Q5TF21 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SOGA3Q5TF21 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms