Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LDLRAD1Q5T700 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LDLRAD1Q5T700 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LDLRAD1Q5T700 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LDLRAD1Q5T700 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LDLRAD1Q5T700 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LDLRAD1Q5T700 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LDLRAD1Q5T700 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LDLRAD1Q5T700 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LDLRAD1Q5T700 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LDLRAD1Q5T700 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LDLRAD1Q5T700 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LDLRAD1Q5T700 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LDLRAD1Q5T700 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LDLRAD1Q5T700 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LDLRAD1Q5T700 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LDLRAD1Q5T700 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LDLRAD1Q5T700 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LDLRAD1Q5T700 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LDLRAD1Q5T700 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LDLRAD1Q5T700 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LDLRAD1Q5T700 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LDLRAD1Q5T700 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LDLRAD1Q5T700 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LDLRAD1Q5T700 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LDLRAD1Q5T700 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LDLRAD1Q5T700 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LDLRAD1Q5T700 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LDLRAD1Q5T700 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LDLRAD1Q5T700 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LDLRAD1Q5T700 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LDLRAD1Q5T700 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LDLRAD1Q5T700 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LDLRAD1Q5T700 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LDLRAD1Q5T700 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LDLRAD1Q5T700 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LDLRAD1Q5T700 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LDLRAD1Q5T700 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LDLRAD1Q5T700 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LDLRAD1Q5T700 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LDLRAD1Q5T700 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LDLRAD1Q5T700 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LDLRAD1Q5T700 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LDLRAD1Q5T700 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LDLRAD1Q5T700 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LDLRAD1Q5T700 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LDLRAD1Q5T700 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LDLRAD1Q5T700 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LDLRAD1Q5T700 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LDLRAD1Q5T700 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LDLRAD1Q5T700 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LDLRAD1Q5T700 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LDLRAD1Q5T700 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LDLRAD1Q5T700 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LDLRAD1Q5T700 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LDLRAD1Q5T700 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LDLRAD1Q5T700 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LDLRAD1Q5T700 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LDLRAD1Q5T700 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LDLRAD1Q5T700 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LDLRAD1Q5T700 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LDLRAD1Q5T700 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LDLRAD1Q5T700 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LDLRAD1Q5T700 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LDLRAD1Q5T700 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LDLRAD1Q5T700 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LDLRAD1Q5T700 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LDLRAD1Q5T700 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LDLRAD1Q5T700 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LDLRAD1Q5T700 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LDLRAD1Q5T700 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LDLRAD1Q5T700 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LDLRAD1Q5T700 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LDLRAD1Q5T700 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LDLRAD1Q5T700 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LDLRAD1Q5T700 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
LDLRAD1Q5T700 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LDLRAD1Q5T700 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LDLRAD1Q5T700 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LDLRAD1Q5T700 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LDLRAD1Q5T700 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LDLRAD1Q5T700 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LDLRAD1Q5T700 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LDLRAD1Q5T700 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LDLRAD1Q5T700 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LDLRAD1Q5T700 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LDLRAD1Q5T700 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LDLRAD1Q5T700 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
LDLRAD1Q5T700 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LDLRAD1Q5T700 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LDLRAD1Q5T700 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LDLRAD1Q5T700 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LDLRAD1Q5T700 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LDLRAD1Q5T700 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LDLRAD1Q5T700 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LDLRAD1Q5T700 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LDLRAD1Q5T700 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LDLRAD1Q5T700 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LDLRAD1Q5T700 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LDLRAD1Q5T700 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms