Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BEND3Q5T5X7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BEND3Q5T5X7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BEND3Q5T5X7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BEND3Q5T5X7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BEND3Q5T5X7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BEND3Q5T5X7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BEND3Q5T5X7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BEND3Q5T5X7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BEND3Q5T5X7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
BEND3Q5T5X7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BEND3Q5T5X7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BEND3Q5T5X7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BEND3Q5T5X7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BEND3Q5T5X7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BEND3Q5T5X7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BEND3Q5T5X7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BEND3Q5T5X7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BEND3Q5T5X7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BEND3Q5T5X7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BEND3Q5T5X7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BEND3Q5T5X7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BEND3Q5T5X7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BEND3Q5T5X7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BEND3Q5T5X7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BEND3Q5T5X7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BEND3Q5T5X7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BEND3Q5T5X7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BEND3Q5T5X7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BEND3Q5T5X7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BEND3Q5T5X7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BEND3Q5T5X7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BEND3Q5T5X7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BEND3Q5T5X7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BEND3Q5T5X7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BEND3Q5T5X7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BEND3Q5T5X7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BEND3Q5T5X7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BEND3Q5T5X7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BEND3Q5T5X7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BEND3Q5T5X7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
BEND3Q5T5X7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BEND3Q5T5X7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BEND3Q5T5X7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
BEND3Q5T5X7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BEND3Q5T5X7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BEND3Q5T5X7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BEND3Q5T5X7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BEND3Q5T5X7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BEND3Q5T5X7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BEND3Q5T5X7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BEND3Q5T5X7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BEND3Q5T5X7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BEND3Q5T5X7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BEND3Q5T5X7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BEND3Q5T5X7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
BEND3Q5T5X7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
BEND3Q5T5X7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
BEND3Q5T5X7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BEND3Q5T5X7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BEND3Q5T5X7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BEND3Q5T5X7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BEND3Q5T5X7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BEND3Q5T5X7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BEND3Q5T5X7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BEND3Q5T5X7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BEND3Q5T5X7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BEND3Q5T5X7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BEND3Q5T5X7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BEND3Q5T5X7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BEND3Q5T5X7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BEND3Q5T5X7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BEND3Q5T5X7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BEND3Q5T5X7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BEND3Q5T5X7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
BEND3Q5T5X7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BEND3Q5T5X7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BEND3Q5T5X7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BEND3Q5T5X7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BEND3Q5T5X7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BEND3Q5T5X7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BEND3Q5T5X7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BEND3Q5T5X7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BEND3Q5T5X7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BEND3Q5T5X7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BEND3Q5T5X7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BEND3Q5T5X7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BEND3Q5T5X7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BEND3Q5T5X7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BEND3Q5T5X7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BEND3Q5T5X7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
BEND3Q5T5X7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BEND3Q5T5X7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BEND3Q5T5X7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BEND3Q5T5X7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
BEND3Q5T5X7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BEND3Q5T5X7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BEND3Q5T5X7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BEND3Q5T5X7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BEND3Q5T5X7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms