Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5B0

LCE3E, Late cornified envelope protein 3E, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCE3EQ5T5B0 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3EQ5T5B0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LCE3EQ5T5B0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms