Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4F4

ZFYVE27, Protrudin, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE27Q5T4F4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZFYVE27Q5T4F4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms