Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NHSL1Q5SYE7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NHSL1Q5SYE7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NHSL1Q5SYE7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NHSL1Q5SYE7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NHSL1Q5SYE7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NHSL1Q5SYE7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NHSL1Q5SYE7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NHSL1Q5SYE7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NHSL1Q5SYE7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NHSL1Q5SYE7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
NHSL1Q5SYE7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NHSL1Q5SYE7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NHSL1Q5SYE7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NHSL1Q5SYE7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NHSL1Q5SYE7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NHSL1Q5SYE7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NHSL1Q5SYE7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NHSL1Q5SYE7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NHSL1Q5SYE7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NHSL1Q5SYE7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NHSL1Q5SYE7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NHSL1Q5SYE7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NHSL1Q5SYE7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NHSL1Q5SYE7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NHSL1Q5SYE7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NHSL1Q5SYE7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NHSL1Q5SYE7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NHSL1Q5SYE7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NHSL1Q5SYE7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NHSL1Q5SYE7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NHSL1Q5SYE7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NHSL1Q5SYE7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NHSL1Q5SYE7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NHSL1Q5SYE7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NHSL1Q5SYE7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NHSL1Q5SYE7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NHSL1Q5SYE7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NHSL1Q5SYE7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NHSL1Q5SYE7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NHSL1Q5SYE7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NHSL1Q5SYE7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NHSL1Q5SYE7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NHSL1Q5SYE7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NHSL1Q5SYE7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NHSL1Q5SYE7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
NHSL1Q5SYE7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
NHSL1Q5SYE7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.48
NHSL1Q5SYE7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
NHSL1Q5SYE7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
NHSL1Q5SYE7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
NHSL1Q5SYE7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
NHSL1Q5SYE7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
NHSL1Q5SYE7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NHSL1Q5SYE7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
NHSL1Q5SYE7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NHSL1Q5SYE7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
NHSL1Q5SYE7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NHSL1Q5SYE7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NHSL1Q5SYE7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NHSL1Q5SYE7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NHSL1Q5SYE7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NHSL1Q5SYE7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NHSL1Q5SYE7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NHSL1Q5SYE7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NHSL1Q5SYE7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NHSL1Q5SYE7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NHSL1Q5SYE7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NHSL1Q5SYE7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NHSL1Q5SYE7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NHSL1Q5SYE7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NHSL1Q5SYE7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NHSL1Q5SYE7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NHSL1Q5SYE7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NHSL1Q5SYE7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NHSL1Q5SYE7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
NHSL1Q5SYE7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
NHSL1Q5SYE7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NHSL1Q5SYE7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NHSL1Q5SYE7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NHSL1Q5SYE7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NHSL1Q5SYE7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NHSL1Q5SYE7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NHSL1Q5SYE7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NHSL1Q5SYE7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NHSL1Q5SYE7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NHSL1Q5SYE7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NHSL1Q5SYE7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NHSL1Q5SYE7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NHSL1Q5SYE7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NHSL1Q5SYE7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
NHSL1Q5SYE7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
NHSL1Q5SYE7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NHSL1Q5SYE7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NHSL1Q5SYE7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NHSL1Q5SYE7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NHSL1Q5SYE7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
NHSL1Q5SYE7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
NHSL1Q5SYE7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
NHSL1Q5SYE7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms