Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HP1BP3Q5SSJ5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms