Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC27A3Q5K4L6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC27A3Q5K4L6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC27A3Q5K4L6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC27A3Q5K4L6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC27A3Q5K4L6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC27A3Q5K4L6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC27A3Q5K4L6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC27A3Q5K4L6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC27A3Q5K4L6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC27A3Q5K4L6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC27A3Q5K4L6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC27A3Q5K4L6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC27A3Q5K4L6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC27A3Q5K4L6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC27A3Q5K4L6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC27A3Q5K4L6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC27A3Q5K4L6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC27A3Q5K4L6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC27A3Q5K4L6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC27A3Q5K4L6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC27A3Q5K4L6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC27A3Q5K4L6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC27A3Q5K4L6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC27A3Q5K4L6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC27A3Q5K4L6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC27A3Q5K4L6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC27A3Q5K4L6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC27A3Q5K4L6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC27A3Q5K4L6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC27A3Q5K4L6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC27A3Q5K4L6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC27A3Q5K4L6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC27A3Q5K4L6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC27A3Q5K4L6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC27A3Q5K4L6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC27A3Q5K4L6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC27A3Q5K4L6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC27A3Q5K4L6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC27A3Q5K4L6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC27A3Q5K4L6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC27A3Q5K4L6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC27A3Q5K4L6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC27A3Q5K4L6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC27A3Q5K4L6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC27A3Q5K4L6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC27A3Q5K4L6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC27A3Q5K4L6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC27A3Q5K4L6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC27A3Q5K4L6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC27A3Q5K4L6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC27A3Q5K4L6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC27A3Q5K4L6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SLC27A3Q5K4L6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC27A3Q5K4L6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC27A3Q5K4L6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC27A3Q5K4L6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC27A3Q5K4L6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC27A3Q5K4L6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC27A3Q5K4L6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC27A3Q5K4L6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC27A3Q5K4L6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC27A3Q5K4L6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC27A3Q5K4L6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC27A3Q5K4L6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC27A3Q5K4L6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC27A3Q5K4L6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC27A3Q5K4L6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC27A3Q5K4L6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC27A3Q5K4L6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC27A3Q5K4L6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC27A3Q5K4L6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC27A3Q5K4L6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC27A3Q5K4L6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC27A3Q5K4L6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC27A3Q5K4L6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC27A3Q5K4L6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC27A3Q5K4L6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC27A3Q5K4L6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC27A3Q5K4L6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC27A3Q5K4L6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC27A3Q5K4L6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC27A3Q5K4L6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC27A3Q5K4L6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC27A3Q5K4L6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC27A3Q5K4L6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC27A3Q5K4L6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC27A3Q5K4L6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC27A3Q5K4L6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC27A3Q5K4L6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC27A3Q5K4L6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC27A3Q5K4L6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC27A3Q5K4L6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC27A3Q5K4L6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC27A3Q5K4L6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC27A3Q5K4L6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC27A3Q5K4L6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC27A3Q5K4L6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC27A3Q5K4L6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC27A3Q5K4L6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
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