Protein–RNA interactions for Protein: Q5JXA9

SIRPB2, Signal-regulatory protein beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRPB2Q5JXA9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIRPB2Q5JXA9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIRPB2Q5JXA9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIRPB2Q5JXA9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIRPB2Q5JXA9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIRPB2Q5JXA9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIRPB2Q5JXA9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIRPB2Q5JXA9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIRPB2Q5JXA9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIRPB2Q5JXA9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIRPB2Q5JXA9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIRPB2Q5JXA9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIRPB2Q5JXA9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIRPB2Q5JXA9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIRPB2Q5JXA9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SIRPB2Q5JXA9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIRPB2Q5JXA9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIRPB2Q5JXA9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIRPB2Q5JXA9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIRPB2Q5JXA9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIRPB2Q5JXA9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIRPB2Q5JXA9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIRPB2Q5JXA9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIRPB2Q5JXA9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIRPB2Q5JXA9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIRPB2Q5JXA9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIRPB2Q5JXA9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIRPB2Q5JXA9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIRPB2Q5JXA9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIRPB2Q5JXA9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIRPB2Q5JXA9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIRPB2Q5JXA9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIRPB2Q5JXA9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIRPB2Q5JXA9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIRPB2Q5JXA9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIRPB2Q5JXA9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIRPB2Q5JXA9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIRPB2Q5JXA9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIRPB2Q5JXA9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SIRPB2Q5JXA9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIRPB2Q5JXA9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIRPB2Q5JXA9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIRPB2Q5JXA9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIRPB2Q5JXA9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIRPB2Q5JXA9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIRPB2Q5JXA9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.2 ms