Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM0

CMPK2, UMP-CMP kinase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK2Q5EBM0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMPK2Q5EBM0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms