Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TDRD12Q587J7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TDRD12Q587J7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TDRD12Q587J7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TDRD12Q587J7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TDRD12Q587J7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TDRD12Q587J7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TDRD12Q587J7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TDRD12Q587J7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TDRD12Q587J7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TDRD12Q587J7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TDRD12Q587J7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TDRD12Q587J7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TDRD12Q587J7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TDRD12Q587J7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TDRD12Q587J7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TDRD12Q587J7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TDRD12Q587J7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TDRD12Q587J7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TDRD12Q587J7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TDRD12Q587J7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TDRD12Q587J7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TDRD12Q587J7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TDRD12Q587J7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TDRD12Q587J7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TDRD12Q587J7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TDRD12Q587J7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TDRD12Q587J7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TDRD12Q587J7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TDRD12Q587J7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TDRD12Q587J7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TDRD12Q587J7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TDRD12Q587J7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TDRD12Q587J7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TDRD12Q587J7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TDRD12Q587J7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TDRD12Q587J7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TDRD12Q587J7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TDRD12Q587J7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TDRD12Q587J7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TDRD12Q587J7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TDRD12Q587J7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TDRD12Q587J7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TDRD12Q587J7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TDRD12Q587J7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TDRD12Q587J7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TDRD12Q587J7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TDRD12Q587J7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TDRD12Q587J7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TDRD12Q587J7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TDRD12Q587J7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TDRD12Q587J7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TDRD12Q587J7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TDRD12Q587J7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TDRD12Q587J7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TDRD12Q587J7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TDRD12Q587J7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TDRD12Q587J7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TDRD12Q587J7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TDRD12Q587J7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TDRD12Q587J7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TDRD12Q587J7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TDRD12Q587J7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TDRD12Q587J7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TDRD12Q587J7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TDRD12Q587J7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TDRD12Q587J7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TDRD12Q587J7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TDRD12Q587J7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms