Protein–RNA interactions for Protein: Q562F6

SGO2, Shugoshin 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO2Q562F6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGO2Q562F6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGO2Q562F6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGO2Q562F6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGO2Q562F6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGO2Q562F6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGO2Q562F6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGO2Q562F6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SGO2Q562F6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGO2Q562F6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGO2Q562F6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGO2Q562F6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGO2Q562F6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGO2Q562F6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGO2Q562F6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGO2Q562F6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGO2Q562F6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGO2Q562F6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGO2Q562F6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGO2Q562F6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGO2Q562F6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGO2Q562F6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGO2Q562F6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGO2Q562F6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGO2Q562F6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SGO2Q562F6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGO2Q562F6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGO2Q562F6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGO2Q562F6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGO2Q562F6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGO2Q562F6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGO2Q562F6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGO2Q562F6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGO2Q562F6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGO2Q562F6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGO2Q562F6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGO2Q562F6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGO2Q562F6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGO2Q562F6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGO2Q562F6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SGO2Q562F6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SGO2Q562F6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SGO2Q562F6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SGO2Q562F6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SGO2Q562F6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms