Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ANKRD39Q53RE8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ANKRD39Q53RE8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms