Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RFTN2Q52LD8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RFTN2Q52LD8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms