Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXA5

KHDC1, KH homology domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC1Q4VXA5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KHDC1Q4VXA5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KHDC1Q4VXA5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KHDC1Q4VXA5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KHDC1Q4VXA5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KHDC1Q4VXA5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KHDC1Q4VXA5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KHDC1Q4VXA5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KHDC1Q4VXA5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KHDC1Q4VXA5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KHDC1Q4VXA5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KHDC1Q4VXA5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KHDC1Q4VXA5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KHDC1Q4VXA5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KHDC1Q4VXA5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KHDC1Q4VXA5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KHDC1Q4VXA5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KHDC1Q4VXA5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KHDC1Q4VXA5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KHDC1Q4VXA5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KHDC1Q4VXA5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KHDC1Q4VXA5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KHDC1Q4VXA5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KHDC1Q4VXA5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KHDC1Q4VXA5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KHDC1Q4VXA5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KHDC1Q4VXA5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KHDC1Q4VXA5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KHDC1Q4VXA5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KHDC1Q4VXA5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KHDC1Q4VXA5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KHDC1Q4VXA5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KHDC1Q4VXA5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KHDC1Q4VXA5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KHDC1Q4VXA5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KHDC1Q4VXA5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KHDC1Q4VXA5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms