Protein–RNA interactions for Protein: Q495D7

LINC01559, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01559, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01559Q495D7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01559Q495D7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms