Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RNF212Q495C1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RNF212Q495C1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms