Protein–RNA interactions for Protein: Q3SX64

ODF3L2, Outer dense fiber protein 3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3L2Q3SX64 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF3L2Q3SX64 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF3L2Q3SX64 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF3L2Q3SX64 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF3L2Q3SX64 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF3L2Q3SX64 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF3L2Q3SX64 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF3L2Q3SX64 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF3L2Q3SX64 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF3L2Q3SX64 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF3L2Q3SX64 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF3L2Q3SX64 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF3L2Q3SX64 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF3L2Q3SX64 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF3L2Q3SX64 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF3L2Q3SX64 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF3L2Q3SX64 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF3L2Q3SX64 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF3L2Q3SX64 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF3L2Q3SX64 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF3L2Q3SX64 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF3L2Q3SX64 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF3L2Q3SX64 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF3L2Q3SX64 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF3L2Q3SX64 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF3L2Q3SX64 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF3L2Q3SX64 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF3L2Q3SX64 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF3L2Q3SX64 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF3L2Q3SX64 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF3L2Q3SX64 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF3L2Q3SX64 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF3L2Q3SX64 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF3L2Q3SX64 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ODF3L2Q3SX64 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF3L2Q3SX64 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF3L2Q3SX64 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF3L2Q3SX64 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF3L2Q3SX64 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF3L2Q3SX64 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF3L2Q3SX64 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF3L2Q3SX64 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF3L2Q3SX64 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF3L2Q3SX64 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF3L2Q3SX64 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF3L2Q3SX64 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF3L2Q3SX64 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF3L2Q3SX64 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF3L2Q3SX64 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF3L2Q3SX64 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF3L2Q3SX64 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF3L2Q3SX64 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF3L2Q3SX64 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF3L2Q3SX64 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF3L2Q3SX64 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF3L2Q3SX64 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF3L2Q3SX64 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF3L2Q3SX64 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF3L2Q3SX64 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF3L2Q3SX64 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF3L2Q3SX64 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF3L2Q3SX64 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF3L2Q3SX64 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF3L2Q3SX64 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF3L2Q3SX64 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF3L2Q3SX64 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF3L2Q3SX64 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF3L2Q3SX64 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF3L2Q3SX64 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF3L2Q3SX64 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF3L2Q3SX64 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF3L2Q3SX64 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF3L2Q3SX64 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ODF3L2Q3SX64 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF3L2Q3SX64 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF3L2Q3SX64 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF3L2Q3SX64 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF3L2Q3SX64 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF3L2Q3SX64 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF3L2Q3SX64 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF3L2Q3SX64 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF3L2Q3SX64 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF3L2Q3SX64 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF3L2Q3SX64 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF3L2Q3SX64 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODF3L2Q3SX64 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF3L2Q3SX64 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF3L2Q3SX64 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF3L2Q3SX64 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF3L2Q3SX64 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF3L2Q3SX64 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF3L2Q3SX64 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF3L2Q3SX64 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF3L2Q3SX64 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF3L2Q3SX64 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF3L2Q3SX64 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF3L2Q3SX64 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF3L2Q3SX64 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF3L2Q3SX64 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODF3L2Q3SX64 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms