Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2W7

C17orf58, UPF0450 protein C17orf58, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf58Q2M2W7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C17orf58Q2M2W7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
C17orf58Q2M2W7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C17orf58Q2M2W7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C17orf58Q2M2W7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C17orf58Q2M2W7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C17orf58Q2M2W7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C17orf58Q2M2W7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C17orf58Q2M2W7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C17orf58Q2M2W7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C17orf58Q2M2W7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C17orf58Q2M2W7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
C17orf58Q2M2W7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
C17orf58Q2M2W7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C17orf58Q2M2W7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C17orf58Q2M2W7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C17orf58Q2M2W7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C17orf58Q2M2W7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C17orf58Q2M2W7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C17orf58Q2M2W7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C17orf58Q2M2W7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C17orf58Q2M2W7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C17orf58Q2M2W7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C17orf58Q2M2W7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C17orf58Q2M2W7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C17orf58Q2M2W7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C17orf58Q2M2W7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C17orf58Q2M2W7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C17orf58Q2M2W7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C17orf58Q2M2W7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C17orf58Q2M2W7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C17orf58Q2M2W7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C17orf58Q2M2W7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
C17orf58Q2M2W7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C17orf58Q2M2W7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C17orf58Q2M2W7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C17orf58Q2M2W7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms