Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GEN1Q17RS7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GEN1Q17RS7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
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