Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IMPG1Q17R60 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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