Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRNQ16849 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRNQ16849 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRNQ16849 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
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