Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PDK4Q16654 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDK4Q16654 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDK4Q16654 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDK4Q16654 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDK4Q16654 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDK4Q16654 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDK4Q16654 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDK4Q16654 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDK4Q16654 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDK4Q16654 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDK4Q16654 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDK4Q16654 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDK4Q16654 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDK4Q16654 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDK4Q16654 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDK4Q16654 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDK4Q16654 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDK4Q16654 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDK4Q16654 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDK4Q16654 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDK4Q16654 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDK4Q16654 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDK4Q16654 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDK4Q16654 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDK4Q16654 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDK4Q16654 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDK4Q16654 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDK4Q16654 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
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