Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRY1Q16526 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRY1Q16526 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRY1Q16526 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRY1Q16526 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRY1Q16526 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRY1Q16526 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRY1Q16526 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRY1Q16526 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRY1Q16526 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRY1Q16526 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRY1Q16526 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRY1Q16526 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRY1Q16526 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CRY1Q16526 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRY1Q16526 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRY1Q16526 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRY1Q16526 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CRY1Q16526 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CRY1Q16526 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CRY1Q16526 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CRY1Q16526 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CRY1Q16526 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRY1Q16526 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms