Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIP13Q15645 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
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