Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF1AQ15573 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
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