Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SKIV2LQ15477 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SKIV2LQ15477 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKIV2LQ15477 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKIV2LQ15477 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKIV2LQ15477 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKIV2LQ15477 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKIV2LQ15477 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKIV2LQ15477 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKIV2LQ15477 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKIV2LQ15477 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKIV2LQ15477 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKIV2LQ15477 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKIV2LQ15477 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKIV2LQ15477 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKIV2LQ15477 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKIV2LQ15477 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SKIV2LQ15477 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKIV2LQ15477 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKIV2LQ15477 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKIV2LQ15477 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKIV2LQ15477 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKIV2LQ15477 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKIV2LQ15477 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKIV2LQ15477 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKIV2LQ15477 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKIV2LQ15477 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKIV2LQ15477 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKIV2LQ15477 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKIV2LQ15477 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKIV2LQ15477 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKIV2LQ15477 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKIV2LQ15477 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SKIV2LQ15477 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SKIV2LQ15477 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKIV2LQ15477 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKIV2LQ15477 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKIV2LQ15477 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKIV2LQ15477 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKIV2LQ15477 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SKIV2LQ15477 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKIV2LQ15477 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKIV2LQ15477 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SKIV2LQ15477 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKIV2LQ15477 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SKIV2LQ15477 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKIV2LQ15477 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKIV2LQ15477 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKIV2LQ15477 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKIV2LQ15477 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKIV2LQ15477 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKIV2LQ15477 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKIV2LQ15477 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKIV2LQ15477 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKIV2LQ15477 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKIV2LQ15477 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKIV2LQ15477 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SKIV2LQ15477 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKIV2LQ15477 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKIV2LQ15477 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKIV2LQ15477 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKIV2LQ15477 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SKIV2LQ15477 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKIV2LQ15477 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKIV2LQ15477 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKIV2LQ15477 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SKIV2LQ15477 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKIV2LQ15477 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKIV2LQ15477 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKIV2LQ15477 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKIV2LQ15477 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKIV2LQ15477 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKIV2LQ15477 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKIV2LQ15477 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SKIV2LQ15477 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SKIV2LQ15477 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKIV2LQ15477 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKIV2LQ15477 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKIV2LQ15477 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKIV2LQ15477 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SKIV2LQ15477 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms