Protein–RNA interactions for Protein: Q15418

RPS6KA1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA1Q15418 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS6KA1Q15418 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS6KA1Q15418 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS6KA1Q15418 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS6KA1Q15418 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPS6KA1Q15418 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS6KA1Q15418 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS6KA1Q15418 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS6KA1Q15418 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS6KA1Q15418 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS6KA1Q15418 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS6KA1Q15418 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS6KA1Q15418 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS6KA1Q15418 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS6KA1Q15418 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS6KA1Q15418 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS6KA1Q15418 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS6KA1Q15418 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS6KA1Q15418 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS6KA1Q15418 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS6KA1Q15418 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS6KA1Q15418 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS6KA1Q15418 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS6KA1Q15418 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS6KA1Q15418 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS6KA1Q15418 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS6KA1Q15418 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS6KA1Q15418 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS6KA1Q15418 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS6KA1Q15418 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS6KA1Q15418 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS6KA1Q15418 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS6KA1Q15418 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS6KA1Q15418 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS6KA1Q15418 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS6KA1Q15418 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS6KA1Q15418 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS6KA1Q15418 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS6KA1Q15418 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS6KA1Q15418 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS6KA1Q15418 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS6KA1Q15418 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS6KA1Q15418 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS6KA1Q15418 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS6KA1Q15418 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS6KA1Q15418 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS6KA1Q15418 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS6KA1Q15418 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS6KA1Q15418 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS6KA1Q15418 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPS6KA1Q15418 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPS6KA1Q15418 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPS6KA1Q15418 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPS6KA1Q15418 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPS6KA1Q15418 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPS6KA1Q15418 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPS6KA1Q15418 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KA1Q15418 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KA1Q15418 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KA1Q15418 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KA1Q15418 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KA1Q15418 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KA1Q15418 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KA1Q15418 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KA1Q15418 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KA1Q15418 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS6KA1Q15418 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS6KA1Q15418 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS6KA1Q15418 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS6KA1Q15418 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS6KA1Q15418 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS6KA1Q15418 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS6KA1Q15418 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KA1Q15418 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KA1Q15418 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KA1Q15418 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KA1Q15418 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KA1Q15418 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KA1Q15418 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KA1Q15418 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KA1Q15418 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KA1Q15418 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KA1Q15418 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KA1Q15418 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KA1Q15418 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KA1Q15418 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KA1Q15418 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KA1Q15418 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KA1Q15418 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KA1Q15418 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KA1Q15418 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KA1Q15418 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KA1Q15418 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KA1Q15418 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KA1Q15418 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KA1Q15418 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KA1Q15418 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KA1Q15418 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS6KA1Q15418 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS6KA1Q15418 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
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