Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PUM3Q15397 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PUM3Q15397 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PUM3Q15397 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PUM3Q15397 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PUM3Q15397 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PUM3Q15397 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PUM3Q15397 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PUM3Q15397 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PUM3Q15397 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PUM3Q15397 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PUM3Q15397 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PUM3Q15397 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PUM3Q15397 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PUM3Q15397 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PUM3Q15397 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PUM3Q15397 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PUM3Q15397 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PUM3Q15397 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PUM3Q15397 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PUM3Q15397 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PUM3Q15397 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PUM3Q15397 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PUM3Q15397 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PUM3Q15397 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PUM3Q15397 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PUM3Q15397 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PUM3Q15397 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PUM3Q15397 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PUM3Q15397 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PUM3Q15397 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PUM3Q15397 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PUM3Q15397 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PUM3Q15397 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PUM3Q15397 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PUM3Q15397 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PUM3Q15397 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PUM3Q15397 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PUM3Q15397 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PUM3Q15397 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PUM3Q15397 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PUM3Q15397 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PUM3Q15397 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PUM3Q15397 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PUM3Q15397 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PUM3Q15397 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PUM3Q15397 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PUM3Q15397 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PUM3Q15397 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PUM3Q15397 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PUM3Q15397 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PUM3Q15397 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PUM3Q15397 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PUM3Q15397 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PUM3Q15397 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PUM3Q15397 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PUM3Q15397 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PUM3Q15397 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PUM3Q15397 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PUM3Q15397 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PUM3Q15397 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PUM3Q15397 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PUM3Q15397 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PUM3Q15397 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PUM3Q15397 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PUM3Q15397 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PUM3Q15397 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PUM3Q15397 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PUM3Q15397 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PUM3Q15397 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PUM3Q15397 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PUM3Q15397 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PUM3Q15397 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PUM3Q15397 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PUM3Q15397 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PUM3Q15397 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PUM3Q15397 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PUM3Q15397 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PUM3Q15397 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PUM3Q15397 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PUM3Q15397 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PUM3Q15397 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PUM3Q15397 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PUM3Q15397 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PUM3Q15397 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PUM3Q15397 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PUM3Q15397 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PUM3Q15397 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PUM3Q15397 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PUM3Q15397 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PUM3Q15397 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PUM3Q15397 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PUM3Q15397 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PUM3Q15397 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PUM3Q15397 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PUM3Q15397 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PUM3Q15397 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PUM3Q15397 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PUM3Q15397 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PUM3Q15397 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
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