Protein–RNA interactions for Protein: Q15388

TOMM20, Mitochondrial import receptor subunit TOM20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM20Q15388 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TOMM20Q15388 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TOMM20Q15388 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TOMM20Q15388 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TOMM20Q15388 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TOMM20Q15388 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TOMM20Q15388 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TOMM20Q15388 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TOMM20Q15388 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TOMM20Q15388 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TOMM20Q15388 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TOMM20Q15388 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TOMM20Q15388 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TOMM20Q15388 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms