Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PDK3Q15120 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDK3Q15120 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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