Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM25Q14258 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM25Q14258 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM25Q14258 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM25Q14258 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM25Q14258 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM25Q14258 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM25Q14258 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM25Q14258 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM25Q14258 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM25Q14258 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM25Q14258 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM25Q14258 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM25Q14258 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM25Q14258 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM25Q14258 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM25Q14258 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM25Q14258 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM25Q14258 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM25Q14258 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRIM25Q14258 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRIM25Q14258 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM25Q14258 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM25Q14258 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM25Q14258 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM25Q14258 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM25Q14258 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM25Q14258 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM25Q14258 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM25Q14258 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM25Q14258 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM25Q14258 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM25Q14258 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM25Q14258 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM25Q14258 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TRIM25Q14258 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM25Q14258 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM25Q14258 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM25Q14258 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM25Q14258 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM25Q14258 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM25Q14258 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM25Q14258 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM25Q14258 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM25Q14258 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM25Q14258 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM25Q14258 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM25Q14258 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM25Q14258 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM25Q14258 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM25Q14258 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM25Q14258 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM25Q14258 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM25Q14258 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM25Q14258 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM25Q14258 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM25Q14258 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM25Q14258 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM25Q14258 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM25Q14258 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM25Q14258 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM25Q14258 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM25Q14258 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM25Q14258 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM25Q14258 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM25Q14258 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM25Q14258 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM25Q14258 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM25Q14258 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM25Q14258 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM25Q14258 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM25Q14258 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM25Q14258 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM25Q14258 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM25Q14258 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM25Q14258 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM25Q14258 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM25Q14258 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM25Q14258 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM25Q14258 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
TRIM25Q14258 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
TRIM25Q14258 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM25Q14258 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM25Q14258 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM25Q14258 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM25Q14258 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM25Q14258 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM25Q14258 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM25Q14258 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM25Q14258 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM25Q14258 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM25Q14258 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM25Q14258 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM25Q14258 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM25Q14258 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM25Q14258 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM25Q14258 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM25Q14258 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM25Q14258 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM25Q14258 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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