Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SCARB2Q14108 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCARB2Q14108 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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