Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CBFBQ13951 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CBFBQ13951 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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