Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2H2Q13888 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2H2Q13888 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2H2Q13888 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2H2Q13888 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2H2Q13888 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2H2Q13888 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2H2Q13888 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2H2Q13888 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2H2Q13888 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2H2Q13888 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF2H2Q13888 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GTF2H2Q13888 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2H2Q13888 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2H2Q13888 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2H2Q13888 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2H2Q13888 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2H2Q13888 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2H2Q13888 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2H2Q13888 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2H2Q13888 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2H2Q13888 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2H2Q13888 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2H2Q13888 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2H2Q13888 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2H2Q13888 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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