Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
EXOSC2Q13868 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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