Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MTMR3Q13615 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MTMR3Q13615 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MTMR3Q13615 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MTMR3Q13615 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MTMR3Q13615 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MTMR3Q13615 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MTMR3Q13615 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MTMR3Q13615 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTMR3Q13615 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTMR3Q13615 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTMR3Q13615 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTMR3Q13615 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTMR3Q13615 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTMR3Q13615 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
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