Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C1orf61Q13536 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf61Q13536 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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