Protein–RNA interactions for Protein: Q13507

TRPC3, Short transient receptor potential channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC3Q13507 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRPC3Q13507 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRPC3Q13507 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRPC3Q13507 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRPC3Q13507 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRPC3Q13507 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRPC3Q13507 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRPC3Q13507 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRPC3Q13507 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRPC3Q13507 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRPC3Q13507 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRPC3Q13507 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRPC3Q13507 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRPC3Q13507 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRPC3Q13507 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRPC3Q13507 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRPC3Q13507 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRPC3Q13507 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRPC3Q13507 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRPC3Q13507 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRPC3Q13507 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRPC3Q13507 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
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