Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
FOXE3Q13461 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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