Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MSLNQ13421 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSLNQ13421 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSLNQ13421 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms