Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SP140Q13342 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SP140Q13342 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SP140Q13342 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SP140Q13342 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SP140Q13342 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SP140Q13342 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SP140Q13342 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SP140Q13342 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SP140Q13342 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SP140Q13342 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SP140Q13342 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SP140Q13342 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SP140Q13342 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SP140Q13342 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SP140Q13342 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SP140Q13342 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SP140Q13342 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SP140Q13342 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SP140Q13342 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SP140Q13342 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SP140Q13342 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SP140Q13342 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SP140Q13342 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SP140Q13342 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SP140Q13342 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SP140Q13342 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SP140Q13342 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SP140Q13342 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SP140Q13342 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SP140Q13342 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SP140Q13342 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SP140Q13342 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SP140Q13342 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SP140Q13342 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SP140Q13342 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SP140Q13342 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SP140Q13342 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SP140Q13342 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SP140Q13342 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SP140Q13342 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SP140Q13342 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SP140Q13342 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SP140Q13342 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SP140Q13342 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SP140Q13342 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SP140Q13342 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SP140Q13342 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SP140Q13342 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SP140Q13342 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SP140Q13342 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SP140Q13342 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SP140Q13342 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SP140Q13342 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SP140Q13342 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SP140Q13342 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SP140Q13342 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SP140Q13342 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SP140Q13342 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SP140Q13342 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SP140Q13342 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SP140Q13342 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SP140Q13342 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SP140Q13342 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SP140Q13342 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SP140Q13342 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SP140Q13342 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SP140Q13342 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SP140Q13342 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SP140Q13342 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SP140Q13342 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SP140Q13342 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SP140Q13342 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SP140Q13342 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SP140Q13342 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SP140Q13342 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SP140Q13342 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SP140Q13342 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SP140Q13342 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SP140Q13342 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SP140Q13342 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SP140Q13342 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SP140Q13342 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SP140Q13342 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SP140Q13342 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SP140Q13342 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SP140Q13342 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SP140Q13342 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SP140Q13342 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SP140Q13342 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SP140Q13342 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SP140Q13342 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SP140Q13342 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SP140Q13342 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SP140Q13342 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SP140Q13342 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SP140Q13342 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SP140Q13342 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SP140Q13342 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SP140Q13342 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
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