Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
MRPL28Q13084 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MRPL28Q13084 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MRPL28Q13084 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms