Protein–RNA interactions for Protein: Q12872

SFSWAP, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFSWAPQ12872 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SFSWAPQ12872 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFSWAPQ12872 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFSWAPQ12872 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
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