Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH17Q12864 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH17Q12864 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH17Q12864 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH17Q12864 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH17Q12864 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH17Q12864 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH17Q12864 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH17Q12864 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH17Q12864 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH17Q12864 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH17Q12864 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH17Q12864 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH17Q12864 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH17Q12864 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH17Q12864 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH17Q12864 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH17Q12864 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH17Q12864 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH17Q12864 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH17Q12864 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH17Q12864 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH17Q12864 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH17Q12864 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH17Q12864 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH17Q12864 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH17Q12864 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH17Q12864 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH17Q12864 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH17Q12864 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH17Q12864 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH17Q12864 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH17Q12864 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH17Q12864 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH17Q12864 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH17Q12864 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH17Q12864 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH17Q12864 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH17Q12864 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH17Q12864 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH17Q12864 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH17Q12864 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH17Q12864 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH17Q12864 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH17Q12864 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH17Q12864 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH17Q12864 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH17Q12864 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH17Q12864 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH17Q12864 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH17Q12864 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH17Q12864 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH17Q12864 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH17Q12864 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDH17Q12864 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
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