Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTN1Q12860 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CNTN1Q12860 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN1Q12860 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
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