Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
STX4Q12846 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
STX4Q12846 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
STX4Q12846 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
STX4Q12846 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
STX4Q12846 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
STX4Q12846 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
STX4Q12846 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
STX4Q12846 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
STX4Q12846 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
STX4Q12846 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
STX4Q12846 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
STX4Q12846 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
STX4Q12846 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
STX4Q12846 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
STX4Q12846 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
STX4Q12846 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
STX4Q12846 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
STX4Q12846 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
STX4Q12846 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
STX4Q12846 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
STX4Q12846 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
STX4Q12846 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
STX4Q12846 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
STX4Q12846 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
STX4Q12846 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
STX4Q12846 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
STX4Q12846 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
STX4Q12846 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
STX4Q12846 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
STX4Q12846 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
STX4Q12846 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
STX4Q12846 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
STX4Q12846 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
STX4Q12846 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
STX4Q12846 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
STX4Q12846 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
STX4Q12846 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
STX4Q12846 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
STX4Q12846 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
STX4Q12846 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
STX4Q12846 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
STX4Q12846 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
STX4Q12846 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
STX4Q12846 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
STX4Q12846 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
STX4Q12846 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
STX4Q12846 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
STX4Q12846 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
STX4Q12846 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
STX4Q12846 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
STX4Q12846 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
STX4Q12846 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
STX4Q12846 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
STX4Q12846 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
STX4Q12846 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
STX4Q12846 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
STX4Q12846 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
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STX4Q12846 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
STX4Q12846 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
STX4Q12846 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
STX4Q12846 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
STX4Q12846 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
STX4Q12846 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
STX4Q12846 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
STX4Q12846 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
STX4Q12846 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
STX4Q12846 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
STX4Q12846 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
STX4Q12846 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
STX4Q12846 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
STX4Q12846 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
STX4Q12846 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
STX4Q12846 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
STX4Q12846 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
STX4Q12846 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
STX4Q12846 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
STX4Q12846 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
STX4Q12846 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
STX4Q12846 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
STX4Q12846 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
STX4Q12846 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
STX4Q12846 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
STX4Q12846 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
STX4Q12846 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
STX4Q12846 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
STX4Q12846 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
STX4Q12846 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
STX4Q12846 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
STX4Q12846 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
STX4Q12846 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
STX4Q12846 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
STX4Q12846 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
STX4Q12846 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
STX4Q12846 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
STX4Q12846 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
STX4Q12846 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
STX4Q12846 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
STX4Q12846 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
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