Protein–RNA interactions for Protein: Q12074

SPE3, Spermidine synthase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3Q12074 ALG9YNL219C 1668 nt4.48□□□□□ -1.69
SPE3Q12074 THI7YLR237W 1797 nt4.48□□□□□ -1.69
SPE3Q12074 YMR221CYMR221C 1515 nt4.47□□□□□ -1.69
SPE3Q12074 NPL4YBR170C 1743 nt4.47□□□□□ -1.69
SPE3Q12074 NAM2YLR382C 2685 nt4.47□□□□□ -1.69
SPE3Q12074 snR57snR57 88 nt4.47□□□□□ -1.69
SPE3Q12074 YGL152CYGL152C 678 nt4.47□□□□□ -1.69
SPE3Q12074 YIL086CYIL086C 309 nt4.47□□□□□ -1.69
SPE3Q12074 YBL077WYBL077W 432 nt4.47□□□□□ -1.69
SPE3Q12074 ARC40YBR234C 1155 nt4.47□□□□□ -1.69
SPE3Q12074 IMD2YHR216W 1572 nt4.47□□□□□ -1.69
SPE3Q12074 GDE1YPL110C 3672 nt4.47□□□□□ -1.69
SPE3Q12074 ARX1YDR101C 1782 nt4.47□□□□□ -1.69
SPE3Q12074 IOC4YMR044W 1428 nt4.46□□□□□ -1.69
SPE3Q12074 MMT1YMR177W 1533 nt4.46□□□□□ -1.69
SPE3Q12074 ARO80YDR421W 2853 nt4.46□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 PER1YCR044C 1074 nt4.46□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 YFR045WYFR045W 930 nt4.46□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 DCS2YOR173W 1062 nt4.46□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 AIM41YOR215C 558 nt4.46□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 TIF4632YGL049C 2745 nt4.46□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 OLE1YGL055W 1533 nt4.46□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 ISR1YPR106W 1332 nt4.46□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 MIH1YMR036C 1665 nt4.45□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 YDR261C-DYDR261C-D 4815 nt4.45□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 FBP26YJL155C 1359 nt4.45□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 DOS2YDR068W 933 nt4.45□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 ERG26YGL001C 1050 nt4.45□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 YHL034W-AYHL034W-A 462 nt4.45□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 YKL071WYKL071W 771 nt4.45□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 YNR061CYNR061C 660 nt4.45□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 YOL050CYOL050C 321 nt4.45□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 TRM44YPL030W 1704 nt4.45□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 KIC1YHR102W 3243 nt4.45□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 PRR2YDL214C 2100 nt4.45□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 RKM3YBR030W 1659 nt4.45□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 SRS2YJL092W 3525 nt4.44□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 YAE1YJR067C 426 nt4.44□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 ATG8YBL078C 354 nt4.44□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 SNF8YPL002C 702 nt4.44□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 CBP3YPL215W 1008 nt4.44□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 EGT2YNL327W 3126 nt4.44□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 ALR2YFL050C 2577 nt4.44□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 YHL012WYHL012W 1482 nt4.43□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 CWH43YCR017C 2862 nt4.43□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 MRP13YGR084C 1020 nt4.43□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 ARD1YHR013C 717 nt4.43□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 TVP38YKR088C 1014 nt4.43□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 JLP1YLL057C 1239 nt4.43□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 YBL081WYBL081W 1107 nt4.43□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 MPD1YOR288C 957 nt4.43□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 SPO19YPL130W 672 nt4.43□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 SUI3YPL237W 858 nt4.43□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 SPC105YGL093W 2754 nt4.43□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 HOM3YER052C 1584 nt4.43□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 PUF2YPR042C 3228 nt4.43□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 TAF12YDR145W 1620 nt4.43□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 TGL1YKL140W 1647 nt4.43□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 THS1YIL078W 2205 nt4.42□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 IME4YGL192W 1803 nt4.42□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 PAH1YMR165C 2589 nt4.42□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 RIA1YNL163C 3333 nt4.42□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 RPB7YDR404C 516 nt4.42□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 API2YDR525W 330 nt4.42□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 EMG1YLR186W 759 nt4.42□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 FBP1YLR377C 1047 nt4.42□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 YLR462WYLR462W 609 nt4.42□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 TAF4YMR005W 1167 nt4.42□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 YPR059CYPR059C 387 nt4.42□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 MDM30YLR368W 1797 nt4.42□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 CUS1YMR240C 1311 nt4.42□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 PUS9YDL036C 1389 nt4.41□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 MET4YNL103W 2019 nt4.41□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 MSK1YNL073W 1731 nt4.41□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 RDH54YBR073W 2877 nt4.41□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 KIN2YLR096W 3444 nt4.41□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 YFL041W-AYFL041W-A 192 nt4.41□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 POP4YBR257W 840 nt4.41□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 PRD1YCL057W 2139 nt4.41□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 SAT4YCR008W 1812 nt4.41□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 BUD8YLR353W 1812 nt4.41□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 PRP19YLL036C 1512 nt4.41□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 SIP1YDR422C 2448 nt4.41□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 IDS2YJL146W 1410 nt4.4□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 PTR3YFR029W 2037 nt4.4□□□□□ -1.7
SPE3Q12074 BUD30YDL151C 582 nt4.4□□□□□ -1.71
SPE3Q12074 PHO13YDL236W 939 nt4.4□□□□□ -1.71
SPE3Q12074 YGL199CYGL199C 471 nt4.4□□□□□ -1.71
SPE3Q12074 CTT1YGR088W 1689 nt4.4□□□□□ -1.71
SPE3Q12074 BCH2YKR027W 2298 nt4.4□□□□□ -1.71
SPE3Q12074 YIL001WYIL001W 1542 nt4.4□□□□□ -1.71
SPE3Q12074 OPT2YPR194C 2634 nt4.39□□□□□ -1.71
SPE3Q12074 JHD2YJR119C 2187 nt4.39□□□□□ -1.71
SPE3Q12074 RPC53YDL150W 1269 nt4.39□□□□□ -1.71
SPE3Q12074 RNA1YMR235C 1224 nt4.39□□□□□ -1.71
SPE3Q12074 SKG6YHR149C 2205 nt4.39□□□□□ -1.71
SPE3Q12074 TRM11YOL124C 1302 nt4.39□□□□□ -1.71
SPE3Q12074 MDM34YGL219C 1380 nt4.39□□□□□ -1.71
SPE3Q12074 MTR10YOR160W 2919 nt4.39□□□□□ -1.71
SPE3Q12074 YOL153CYOL153C 1746 nt4.38□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.2 ms